病原宏基因组高通量测序技术质量评价参考品的建立

作者：刘东来; 沈舒; 田颖新; 周海卫; 张樱^*; 许四宏^*

来源：分子诊断与治疗杂志, 2022, 14(05): 727-730.

DOI：10.19930/j.cnki.jmdt.2022.05.003

• 病原宏基因组高通量测序
• 质量评价
• 参考品

目的 建立医疗机构病原宏基因组高通量测序(mNGS)本地化检测质量评价所需参考品。方法 10种微生物按1∶10梯度稀释3个浓度水平后，分别与临床样本相近的人源细胞浓度混合。人源细胞按1∶10梯度稀释3个浓度水平后，分别与低浓度微生物混合。对参考品冻融稳定性进行研究。结果 D1系列参考品包含：人源细胞为105cells/mL，微生物约为105～103CFU/mL的D1-1～D1-3以及不含微生物的D0；微生物约为103CFU/mL，人源细胞为105～103cells/mL的D1-3、D1-2(10)和D1-1(100)。D2系列参考品与D1系列设置相同。对参考品进行检测(以D1系列为例)：D1-1～D1-3各检测1次，参考品中微生物均检出、其他微生物未检出；D1-2重复检测3次，各微生物检出序列数的变异系数为18%～49%;D1-1～D1-3以及D1-3、D1-2(10)和D1-1(100)两组参考品中各微生物检出的序列数的线性相关系数|r|为0.86～0.96。参考品冻融2次后检测，各微生物的检出序列数均下降。结论 建立了包含10种微生物的参考品及其使用方法，可用于医疗机构mNGS本地化检测质量评价。

• 单位
  中国食品药品检定研究院; 中国人民解放军总医院