HBV转染肝癌细胞系基因表达谱改变的研究

作者：黄健; 孙朝晖; 邹军荣; 朱晓艳; 熊英俊

来源：重庆医学, 2011, 40(11): 1052-1054.

• 肝炎病毒
• 乙型
• 寡核苷酸微阵列
• 表达谱

目的利用寡核苷酸芯片筛选HBV感染应答基因,探讨HBV感染分子致病机制。方法选用Agilent Human 1AOligo基因芯片进行乙型肝炎基因表达改变的研究,用Cy3标记实验细胞(HepG2.2.15细胞),Cy5标记对照组细胞(HepG2细胞),比较HepG2.2.15细胞与HepG2细胞之间的基因表达谱差异;用适时定量PCR(RQ-PCR)对部分差异基因进行验证。结果通过杂交、扫描、统计学分析,根据P Value LogRatio值及gProcessed signal/rProcessed signal值从近20 000个基因中共筛选出差异表达基因744个,其中423个基因表达上调,321个基因表达下调。用RQ-PCR技术对其中4个相关基因胰岛素样生长因子2(IGF2)、甲胎蛋白(AFP)、干扰素同源序列结合蛋白(ICSBP)、核糖核苷酸还原酶缩多氨酸M1(RRM1)的表达差异进行了验证,与表达谱的结果基本保持一致。结论通过验证,表达谱芯片的杂交结果真实可靠,为下一步继续进行差异表达基因的研究、了解HBV的致病机制打下了基础。

• 单位
  广州军区广州总医院; 江西省樟树市人民医院检验科