基于TCGA分析肝细胞癌组织miR-5003-3p表达变化及其与患者预后的关系

作者：别蓓蓓; 白宏; 方欢乐; 吴梦迪

来源：山东医药, 2021, 61(35): 6-9.

• 肝细胞癌
• miR-5003-3p
• 生物信息学
• 癌症基因图谱数据库
• 预后

目的分析肝细胞癌(HCC)组织中miR-5003-3p的表达变化,探讨其与患者临床参数、预后的关系。方法利用癌症基因图谱(TCGA)数据库下载375例份HCC组织样本和50例份癌旁组织样本的微小RNA(miRNAs)测序数据,并收集375例患者的临床资料。采用生物信息学方法观察miR-5003-3p在HCC组织中的表达变化,分析其与患者临床参数的相关性。通过绘制受试者工作特征(ROC)曲线评估miR-5003-3p在HCC预后判断中的价值,运用COX比例风险回归模型分析miR-5003-3p对患者预后的影响。结果 HCC组织(375例份)和癌旁组织(50例份)中miR-5003-3p相对表达量分别为0.432±0.429、0.160±0.233,二者比较P<0.01;配对的HCC组织和癌旁组织(各49例份)中miR-5003-3p相对表达量分别为0.547±0.491、0.163±0.233,二者比较P<0.01。375例HCC患者根据miR-5003-3p表达中位数分为高表达组187例、低表达组187例。miR-5003-3p表达与T分期(OR=1.955)、病理分期(OR=1.763)和肿瘤状态(OR=1.659)有显著相关性(P均<0.05)。高表达组10年总生存期(OS)、疾病特异生存期(DSS)和无进展间隔期(PFI)均显著低于低表达组(P均<0.01)。ROC曲线结果显示,miR-5003-3p预测HCC患者1、3、5年OS的曲线下面积(AUC)分别为0.655、0.627、0.586,预测HCC患者1、3、5年DSS的AUC分别为0.720、0.640、0.582,预测HCC患者1、3、5年PFI的AUC分别为0.581、0.614、0.644。miR-5003-3p表达升高(HR=1.788,P=0.017)是影响HCC患者OS的独立危险因素。结论 HCC组织miR-5003-3p表达升高,miR-5003-3p异常高表达是HCC患者预后不良的独立危险因素,并对患者预后具有良好的预测价值。

• 单位
  西安培华学院