基于生物网络模块探讨慢痞消治疗慢性萎缩性胃炎的作用机制

作者：李园; 丁霞; 许爱丽; 曹琬琛; 李萍; 苏泽琦^*

来源：北京中医药大学学报, 2019, 42(08): 673-679.

• 慢性萎缩性胃炎
• 慢痞消
• 生物网络
• 靶点

目的通过生物网络及模块化分析方法挖掘路志正教授临床经验方慢痞消治疗慢性萎缩性胃炎(CAG)的潜在作用靶点和信号通路,从生物信息学角度阐释其潜在作用机制。方法综合利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、BATMAN-TCM、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、人类表型术语集(HPO)和DisgeNet数据库分别获得慢痞消的有效成分和对应靶点以及CAG的相关靶点;通过人类蛋白质参考数据库(HPRD)和生物通用交互数据集库(BioGRID)获取已知的蛋白相互作用关系(PPI),构建"慢痞消-CAG"的PPI网络;通过ClusterONE软件挖掘核心功能模块;采用Cluego软件对其进行基因本体论(GO)功能注释以及京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。结果检索获得慢痞消成分对应基因1 885个,CAG相关基因209个;构建"慢痞消-CAG"PPI网络有44个节点,292条边,其中核心网络模块由31个节点构成;GO功能注释和KEGG信号通路富集分析发现慢痞消治疗CAG的作用机制可能与调控白介素17信号通路(IL-17)、炎性肠病、缺氧诱导因子-1信号通路(HIF-1)、血管内皮生长因子(UEEF)信号通路等炎症反应和肿瘤相关信号通路,以及参与细胞分化、代谢、凋亡等GO功能有关,尤其对肿瘤蛋白53(TP53)、白介素家族细胞因子、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2/COX-2)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、血管内皮生长因子A(VEGFA)和表皮生长因子受体(EGFR)等靶点具有重要调节作用。结论慢痞消可能通过调节免疫炎性反应和血管内皮生长因子等改善胃内微环境,发挥治疗CAG和控制慢性胃炎恶性转化的作用。本研究一方面为明确慢痞消的药理、药效机制提供了有益探索;一方面也为阐释名医经验方的作用机制研究提供了思路和方法学借鉴。

• 单位
  北京中医药大学东直门医院; 中国中医科学院望京医院; 北京中医药大学