基于PEG胁迫表达谱发掘调控谷子干旱胁迫的泛素连接酶E3基因

作者：宋敏; 马芳芳; 侯思宇; 张雁明; 刘龙龙; 耿潞阳; 江璇宇; 李红英; 韩渊怀

来源：山西农业大学学报(自然科学版), 2016, (12): 860-867.

DOI：10.13842/j.cnki.issn1671-8151.2016.12.005

• 谷子
• 泛素连接酶E3
• 干旱胁迫
• 表达谱 Foxtail millet
• Ubiquitin ligase E3
• Drought stress
• Expression profile

[目的]探析谷子调控干旱胁迫的E3基因。[方法]本文基于二代测序技术获得勾勾母鸡咀(GG)和晋汾16(JF)在PEG胁迫下的转录表达谱数据,运用生物信息学检索筛选出11个干旱相关的E3基因,对其理化性质、功能域、启动子元件、表达模式以及与其它物种E3基因的系统进化分析。[结果]蛋白等电点介于4.78~8.88之间,功能域主要为ZF_UBR型、ZF_RING和U_BOX型三类,启动子序列包含干旱诱导响应元件MBS或脱落酸响应元件ABRE等,其中Si001665m和Si022170m与PUB22/23亲缘关系较近,Si029090m与PUB19亲缘关系较近。[结论]初步确定这些是调控谷子干旱胁迫的...

• 单位
  山西农业大学