pre-CTXφ噬菌体在霍乱弧菌基因组中的遗传多样性研究

作者：郝彤宇; 马嘉嘉; 武雅蓉; 钱修伟; 张湘莉兰; 崔玉军^*

来源：疾病监测, 2022, 37(11): 1403-1407.

• 霍乱弧菌
• pre-CTXφ
• 拷贝数变异
• 细菌基因组
• 噬菌体
• 毒力因子

溶原性噬菌体CTXφ携带的ctxAB基因是霍乱弧菌产毒株最主要的毒力基因，而pre-CTXφ作为CTXφ的前体，缺失ctxAB基因编码序列。基因组中整合了pre-CTXφ噬菌体的霍乱弧菌非产毒株，可通过其携带的zot和ace基因，引起患者轻度至中度的霍乱样腹泻症状，存在公共卫生风险。本研究收集了公开发表的1 649株霍乱弧菌草图序列和43株完成图序列，使用比较基因组学和群体遗传学方法，对上述霍乱弧菌数据集进行综合分析，结果表明：不同谱系霍乱弧菌基因组中pre-CTXφ的拷贝数存在差异；其中L3b.4菌株中pre-CTXφ拷贝数呈现随分离年份增加的趋势。L2、L4、L7和L3b谱系存在pre-CTXφ与CTXφ共整合的现象，并发现pre-CTXφ位于pre-CTXφ/CTXφ噬菌体家族系统发育树的祖先位置。这些发现进一步丰富了对霍乱弧菌基因组中pre-CTXφ/CTXφ噬菌体家族遗传多样性的认识，为阐明其整合机制和进化规律提供了必要基础，并为携带此类噬菌体霍乱弧菌的检测及防控提供借鉴。

• 单位
  基础医学院; 安徽医科大学; 解放军总医院