天津地区汉坦病毒分离株TJJ16S基因片段克隆和序列分析

作者:李力; 杨东靖; 陈锦英; 丁建清; 苏旭; 田永琴; 魏骏飞
来源:中华微生物学和免疫学杂志, 2005, 25(8): 652-655.
DOI:10.3760/j:issn:0254-5101.2005.08.012

摘要

目的了解天津地区汉坦病毒分离株TJJ16 S基因的分子特征. 方法采用细胞培养法从鼠肺标本中分离汉坦病毒,命名为TJJ16,提取TJJ16感染Vero-E6细胞的总RNA,经逆转录扩增病毒cDNA,继而进行PCR扩增S基因片段,纯化后克隆于pMD-18T载体,测定核苷酸序列并进行分析. 结果天津地区首次从社鼠中分离出汉坦病毒TJJ16,其S基因片段全序列长为1701 nt.只有1个编码N蛋白的开放读码框架(ORF),起始密码子为第37 nt,终止于1326 nt,推导其编码的蛋白长为429个氨基酸.经核苷酸系统发生树分析,TJJ16株应归属为汉坦病毒的汉滩型(HTN型)毒株,与HTN型新亚型A16株同属一个亚型. 结论 TJJ16病毒株的分离与S基因片段序列分析,证实在天津市鼠间存在HTN型汉坦病毒感染,对临床和流行病学的研究具有重要意义.

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