盐胁迫下不同品种水稻的基因表达

作者：朱长保; 徐辰峰; 李均乾; 刘仁梅; 孙高宝

来源：安徽农业科学, 2018, 46(36): 18-28.

DOI：10.13989/j.cnki.0517-6611.2018.36.005

• 水稻
• 盐胁迫
• 差异基因表达

[目的]初步探索水稻耐盐机制,筛选关键基因。[方法]从公共基因芯片数据库GEO(Gene Expression Omnibus)搜索有关盐胁迫下水稻基因表达的数据,利用TAC(Transcriptome Analysis Console)筛选表达差异基因,对差异基因进行GO(Gene Ontology)富集分析、信号通路富集分析。[结果]在盐胁迫下,CSR11、PL177两种耐受型水稻与IR64、VSR156两种敏感型水稻分别有3 289、1 934、1 806、4 426个基因表达。耐受型水稻中同时上调或下调的基因有288个,敏感型水稻中同时上调或下调的基因有330个。通过生物信息学研究发现,耐受型水稻盐胁迫主要影响代谢途径、次级代谢产物合成、转录因子等方面。敏感型水稻盐胁迫影响主要影响胁迫响应、激素转导、物质代谢等方面。[结论]利用生物信息学方法能有效筛选目标基因,并可为进一步研究提供依据。