摘要

枯草芽孢杆菌SNBS-3是从东北传统豆酱中分离获得的一株具有较强抑菌活性的微生物。为了详细解析SNBS-3的基因组特征,本研究在前期研究的基础上,采用Illumina二代测序技术和第三代高通量Pacbio测序平台对从传统豆酱中筛选得到的枯草芽孢杆菌SNBS-3进行全基因组测序,获得菌株基因组特征信息、基因功能注释及分类、系统发育进化和次级代谢产物等关键信息。结果表明:SNBS-3的基因组为一条环状闭合DNA,大小为4076387bp,共有4000个蛋白质编码基因,在COG、GO、KEGG、CAZY、CARD和VFDB数据库中分别注释到3209、2824、2560、147、12和4个功能基因。应用在线软件AntiSMASH和Bagel4发现其除具有合成Surfactin、Mycosubtilin、Plipastatin、Bacilysin和Bacillaene等多种抑菌物质的相关基因外,还具有一条完整的细菌素Subtilosin A合成基因簇,结合抑菌试验和蛋白酶k试验结果推测枯草芽孢杆菌SNBS-3具有合成细菌素Subtilosin A的能力。综上,枯草芽孢杆菌SNBS-3全基因组测序结果表明其本身可产生多种抑菌物质,是一株具有生防潜力的微生物,相关分析结果对包括细菌素Subtilosin A在内的多种抑菌物质进一步开发应用提供理论基础。