冷战结束后,美尼关系处于低潮。9.11事件后,反对国际恐怖主义成为两国关系发展的平台。2005年2月1日,尼泊尔国王发表王室文告,解散了民选政府。美国随即以“民主倒退”为由宣布暂时停止对尼援助,双边政府交往亦陷入停顿。但仅仅5个月后,美国又做出恢复对尼援助决定,并支持尼泊尔王国政府打击“毛派”(Maoist)武装。美尼关系因此步入一个新的发展阶段。