基于网络药理学与分子对接探究雷公藤致心脏毒性的作用机制

作者:谭国耀; 张庚弋; 谢子薇; 秦之焱; 赵钟祥; 金晶*
来源:中国药师, 2021, 24(11): 2024-2032.
DOI:10.19962/j.cnki.issn1008-049X.2021.11.012

摘要

目的:基于网络药理学方法初步探究雷公藤致心脏毒性靶点及作用机制,为雷公藤的心脏毒性研究提供理论依据。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)收集雷公藤有效成分及其相应靶点,与生物信息数据库Genecards中收集的心脏毒性靶点进行匹配,得雷公藤有效成分的心脏毒性靶点,利用生物信息分析软件Cytoscape3.8.0构建雷公藤有效成分-心脏毒性靶点网络图。通过String数据库构建雷公藤心脏毒性靶点蛋白相互作用网络图。同时通过生物信息学资源数据库DAVID对潜在毒性靶点进行基因本体(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,得到潜在的毒性靶点所涉及到的相关生物学过程和代谢通路。最后通过分子模拟软件Discovery Studio对关键心脏毒性靶点与雷公藤主要毒性成分雷公藤甲素进行分子对接。结果:通过TCMSP数据库和Genecards数据库的筛选,得到25种雷公藤的主要毒性成分以及90个潜在的心脏毒性靶点。雷公藤的活性化合物中,雷公藤甲素、蜜桔黄素、豆甾醇等为心脏毒性作用靶点较多的几个化合物。前列腺素内过氧化物合酶(PTGS2)、心脏电压门控钠离子通道(SCN5A)、电压门控钾离子通道(KCNH2)等均为雷公藤心脏毒性中高频作用的靶点。KEGG结果表明,雷公藤可能作用于细胞凋亡和氧化应激等通路导致心脏毒性的发生。分子对接结果显示,雷公藤甲素与白细胞介素8 (CXCL8)和丝裂原激活蛋白激酶8 (MAPK8)具有较好的结合活性。结论:应用网络药理学的方法,初步揭示了雷公藤引起心脏毒性的作用靶点以及相关作用通路,为进一步研究雷公藤的心脏毒性提供理论依据。

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