利用BSA-Seq方法定位一个水稻早衰相关基因OsBRCA1

作者：蒋家焕; 朱永生; 陈丽萍; 郑燕梅; 蔡秋华; 谢华安; 王爱荣; 张建福^*

来源：福建农业学报, 2022, 37(02): 131-137.

DOI：10.19303/j.issn.1008-0384.2022.002.001

• 水稻
• 突变体
• 早衰
• 基因克隆
• BSA-seq

【目的】水稻早衰突变体是研究水稻衰老机制的良好载体。定位和克隆水稻早衰相关基因，有助于理解水稻早衰的遗传规律和分子机制，为相关基因的作用机制研究奠定基础。【方法】用EMS化学诱变处理粳稻云引，获得一个稳定遗传的早衰突变体w14，与日本晴杂交构建F2分离群体，并在群体中各选择100个隐性单株和显性单株的DNA等量混合，利用BSA-seq分析两个DNA池之间的差异位点，定位水稻早衰相关基因。【结果】突变体w14的早衰表型受单隐性基因控制，对两个DNA池测序结果进行单基因定位和突变基因的鉴定，发现单基因主峰位于Chr3，候选区间为Chr3:27.5～29.5 Mb，进一步在目标区域内找到2个符合条件的候选因果变异。【结论】候选基因LOC＿Os03g49210突变位点是由野生型的C突变为T，且该突变位于候选基因的第2外显子上，属于错义突变，造成了该基因编码的第20个氨基酸由T(苏氨酸)变成I(异亮氨酸)，从而可能导致了基因功能的改变，因此，将该基因定为本研究的候选基因，因与人类BRCA1同源，命名为OsBRCA1。

• 单位
  福建农林大学; 福建省农业科学院