SARS-CoV-2感染与非感染人群血清1-10 ku蛋白质组差异性分析

作者：王磊; 张炳华; 杨文涛; 秦天; 侯雪新; 王冀涛; 肖迪^*

来源：中国病原生物学杂志, 2021, 16(10): 1115-1128.

DOI：10.13350/j.cjpb.211001

• 血清
• 差异蛋白质组
• SARS-CoV-2
• COVID-19
• 生物标志物

目的通过比较分析新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染人群与新冠肺炎疫情爆发前后非SARS-CoV-2感染人群血清的差异蛋白质组,从蛋白水平发现SARS-CoV-2感染人群1-10 ku的特异性血清生物标志物,并确定新冠肺炎疫情爆发前后非SARS-CoV-2感染人群1-10 ku血清蛋白表达的差异性。方法采集166例新冠肺炎爆发前非SARS-CoV-2感染人群血清、245例新冠肺炎爆发后非SARS-CoV-2感染人群血清及228例SARS-CoV-2感染人群血清,每组血清标本分为3份进行预混,形成3组生物学重复,弱阳离子磁珠富集后使用非标记蛋白质组定量技术对富集得到的1-10 ku小分子蛋白或多肽进行非标定量分析。结果蛋白质组学定量分析得到332个蛋白。差异分析显示,新冠肺炎疫情爆发前后非SARS-CoV-2感染人群血清蛋白组分构成差异无统计学意义(P>0.05),SARS-CoV-2感染人群血清与新冠肺炎疫情爆发前后非SARS-CoV-2感染人群血清相比,筛选到差异蛋白49个(上调表达蛋白20个,下调表达蛋白29个),其中19个差异蛋白已作为癌症、心脑血管等其他疾病的诊断或者预后生物标志物。IPA经典信号通路分析显示,差异蛋白显著富集到LXR/RXR途径、FXR/RXR途径、急性期反应信号传导、补体系统、巨噬细胞IL-12信号传导与产生、凝血系统、网格蛋白介导的内吞信号传导等通路。IPA疾病功能分析显示,差异蛋白富集到细胞妥协、炎症反应、传染性疾病、蛋白合成等。在血液中检测到PEBP4、SH3BGRL3基因产物,以及GNPTG、THBS1、HSPG2、MAN1A1、LGALS3BP、CLSTN1、IGFALS、PCOLCE、PGLYRP2、PRG4、QSOX1、SPARC、ATRN 13个未曾报道的与SARS-CoV-2感染相关的差异表达基因。结论新冠肺炎疫情爆发前后非SARS-CoV-2感染人群血清1-10 ku蛋白组分无显著不同,而SARS-CoV-2感染人群血清与非SARS-CoV-2感染人群血清相比存在多个差异蛋白,为新型冠状病毒病(COVID-19)的致病机制和治疗靶点研究提供了依据。

• 单位
  太原市疾病预防控制中心; 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所; 传染病预防控制国家重点实验室