判别分析驱动的微阵列数据的降维策略

作者：荀鹏程; 钱国华; 富春枫; 于浩; 陈峰

来源：中国卫生统计, 2009, 26(2): 147-149,153.

DOI：10.3969/j.issn.1002-3674.2009.02.010

• 降维策略
• 判别分析
• 微阵列数据
• FDR基因得分

目的 探究判别分析驱动的微阵列数据之降维策略.方法 3步降维策略.即首先采用"单变量检验FDR控制"结合"相关矩阵差值综合评分法"的预选维;其次采用PCA、PLS等方法作进一步降维;最后用逐步判别的思想筛选.结果 以Alon等的结肠癌数据为例展示了该3步降维策略在判别分析过程中的应用,组内回代错误率为9.68%,弃一法交叉验证的错误率为11.29%.结论 本文提出的"初步选维→进一步降维→逐步判别筛选"的3步降维策略对于后续的微阵列数据判别分析是实用、可行的.

• 单位
  南京医科大学; 公共卫生学院