脊尾白虾丝氨酸羟甲基转移酶基因的克隆及其表达特征分析

作者：孙金秋; 徐莞媛; 马杭柯; 高威; 欧阳乐飞; 高焕; 阎斌伦^*

来源：渔业科学进展, 2020, 41(01): 127-134.

DOI：10.19663/j.issn2095-9869.20181229001

• 脊尾白虾
• 丝氨酸羟甲基转移酶基因
• 基因克隆
• 组织表达
• Cd2+胁迫

本研究根据脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)转录组序列,采用c DNA末端快速扩增技术克隆获得了脊尾白虾丝氨酸羟甲基转移酶基因(SHMT)。该基因c DNA全长为1855 bp,其中,开放阅读框为1407 bp,5?端非编码区为39 bp,3?端非编码区为409 bp,共编码468个氨基酸,预测蛋白质的分子质量为152.55 kDa,理论等电点为4.90。同源性分析显示,脊尾白虾SHMT基因与甲壳类动物真宽水蚤(Eurytemora affinis)同源性最高,为96%。荧光定量分析结果显示,SHMT基因在脊尾白虾眼柄、胃、肝胰腺、心脏、鳃、肠、肌肉、腹索神经、皮下脂肪以及卵巢中均有表达,其中,卵巢表达量最高,心脏次之。不同浓度Cd2+胁迫结果显示,其在低浓度(0.0100、0.0175和0.021 mmol/L)Cd2+胁迫中的表达模式基本一致,呈先升高后下降再升高再下降的趋势;而在高浓度(0.0278 mmol/L)Cd2+胁迫中,该基因表达量很低,甚至不表达,说明高浓度Cd2+胁迫可以抑制该基因的表达,具体机制有待进一步研究。

• 单位
  江苏省海洋资源开发研究院（连云港）; 江苏省海洋生物技术重点实验室