14株H3亚型禽流感病毒全基因组序列分析

作者：程善菊; 李金平; 侯广宇; 彭程; 王素春; 蒋文明^*; 温建新^*

来源：中国兽医杂志, 2018, 54(10): 30-35.

• H3亚型禽流感病毒
• 全基因测序
• 同源性
• 遗传演化分析

为了解2016年至2017年在我国部分省市活禽市场的家禽体内分离得到的14株H3亚型禽流感病毒的流行情况和遗传特点。采用RT-PCR技术对这14株H3亚型禽流感毒株的全基因进行扩增,并对所得序列进行遗传演化分析。14株分离株中有5株H3N8,7株H3N2,2株H3N3。结果表明,14株毒株中AIV的HA蛋白的裂解位点氨基酸序列均为PE-KQTR↓GLF,只有1个碱性氨基酸,符合低致病性禽流感的分子特征。HA基因的受体结合位点为226(Q)、228(G)具有典型的禽源特征。遗传进化分析表明,除了毒株A/Duck/Fujian/F1142/2016(H3N8)的NS基因属于北美分支外,其余毒株全部基因均属于欧亚分支。通过对H3亚型AIV的遗传进化关系和流行情况进行分析,以期对H3亚型AIV的进化研究提供一些参考依据。

• 单位
  青岛农业大学; 中国动物卫生与流行病学中心