摘要
目的研究大头金蝇蛹的发育调控、环境适应、表观调控等问题,以获得不同发育时期转录组数据,为法医学应用奠定基础。方法饲养大头金蝇,待其化蛹,从开始化蛹至羽化出成虫,每每24 h收集1次,次收集3粒蝇蛹,-80℃保存备用。采用Illumina Hiseq4000进行高通量测序,获得的非重复序列基因(Unigene),使用NCBI比对工具B据LA库ST进分别与行比对N,获R、得ST相R应IN的G、注SW释I信SS息-P,R采O用T瑞士蛋白质数据库(包括每百万测序碱基中基因外P显fa子m)、GO数据库、COG数据库、KEGG数每千个碱基长度中所包含的测序片断数(方得fragments per kilobase of exon model per million mapped reads,FPKM)法计算测序所Unigene在值6个不同发育时期大头金蝇蛹的表达量,并以不同发育时期FPKM表达量比的log2倍数绝对值大于1(即log2|FC|>1)及错误发现率小于0.05为标准进行差异基因筛选。结果平均温度为25.6℃时,大头金蝇蛹从开始化蛹至羽化出成虫历时6 d,共获得43 408条Unigene,平均长度为905 bp,在得NR、SWISS同-P发OR育T、时P期fam、蛹两ST两RI比NG、较进KE行GG差数据库分别有异基因分析,差32异5表00、达1基8 7因20、数1有3 542、9 191、18 720条Unigene获注释,将不数金蝇蛹转录组数据在不同发育时期基因表达具有8差01异~5性30,7个,差异表达基因总45 676个。结论大头为进一步探究嗜尸性蝇蛹各个时期转录组变化提供了良好的基础,为挖掘大头金蝇蛹发育相关基因提供依据。
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