财政拨款是行政事业单位收入的主要来源,行政事业单位内部控制的有效进行可以提升资金的利用率,同时能够综合提升行政事业单位各项关键工作的效率。论文对当前行政事业单位内部控制存在的问题进行梳理,同时分析内部控制和全面质量管理整合的可行性,在此基础上,提出全面质量管理整合策略,为政府机构改革及行政事业单位管理决策科学化提供参考和借鉴。