C组轮状病毒主要基因全片段扩增及武汉地方株Wu82的VP6和VP7编码基因序列分析

作者：王远虹; 周璇; 小林宣道; 朱泽荣; 刘满清; 杨占秋

来源：中国人兽共患病学报, 2007, (12): 1167-1171.

• 轮状病毒
• C组
• 基因
• 序列测定
• 进化分析
• 亲水性分析 rotavirus
• group C
• gene
• sequencing
• phylogenetic analysis
• hydrophilicity analysis

目的建立C组轮状病毒VP6、VP7、VP4和NSP4基因全片段扩增方法;明确武汉地方株Wu82与其他毒株的系统发生关系。腹泻患者大便。方法PAGE筛查病毒;设计9对引物RT-PCR扩增VP6、VP7、VP4和NSP4基因;VP6、VP7序列及亲水位点分析。结果Wu82VP6和VP7基因核酸序列与其它人C组轮状病毒相比同源性分别为98.45%～97.12%和99.34%～94.83%。结论C组轮状病毒基因非常保守,进化缓慢。2001年武汉地方株Wu82与1995年武汉地方株208株相比,VP7和VP6抗原表位存在差异。

• 单位
  武汉市疾病预防控制中心; 日本札幌医科大学; 武汉大学; 病毒学国家重点实验室