基于COⅠ基因序列的日本医蛭疑似种鉴定

作者：余米; 苏胜齐; 周梦; 曹敏^*; 封孝兰

来源：西南大学学报(自然科学版), 2022, 44(10): 74-80.

DOI：10.13718/j.cnki.xdzk.2022.10.009

• 日本医蛭
• 细胞色素氧化酶Ⅰ亚基
• 物种鉴定

采用线粒体COⅠ(细胞色素氧化酶Ⅰ亚基，tochrome oxidasesubunit Ⅰ)基因序列鉴别日本医蛭及其常见疑似种，并分析其遗传多样性和亲缘关系.以日本医蛭及其疑似种为材料，提取线粒体DNA,扩增其COⅠ基因后进行测序，并计算遗传距离和聚类分析.结果显示，日本医蛭COⅠ序列长度为680 bp,碱基A,T,C,G质量分数分别为35.1%,28.7%,16.2%和20.0%,碱基AT质量分数为63.8%;疑似种YS1～YS10的碱基A,T,C,G平均质量分数分别为39.8%,29.4%,15.2%和14.9%,碱基AT质量分数为69.2%. 11种蛭类COⅠ序列中有569个一致位点，84个变异位点，其中，40个位点发生了碱基转换，44个位点发生了碱基颠换，转换与颠换的比值为0.90.日本医蛭与疑似种的遗传距离在0.159～0.166之间.基于COⅠ序列的DNA条形码技术可以很好地鉴定正品日本医蛭与其疑似种，本试验鉴定的疑似种均不是日本医蛭.

• 单位
  西南大学; 重庆市药物种植研究所