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摘要
利用病毒宏基因组学(Viral metagenomics)方法，本研究从95份林麝粪便样品中检测到一株新型圆环病毒样（Circovirus-like）病毒，经过拼接获得其全基因组序列，该毒株命名为ls-cyc。其基因组全长约3552 nt，GC含量39.00%，含有2个开放阅读框（Open reading frame, ORF），即ORF1和ORF2。其中ORF1长度为1386 nt，ORF2长度为1953 nt。ORF1编码的氨基酸序列与来自猪血清圆环状病毒的（MH170058.1）序列相似度为34.31%。系统进化分析表明其与来自猪的圆环状病毒（MH170058.1）和鸭相关环状病毒（NC...
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单位江苏大学; 成都大熊猫繁育研究基地; 四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室
