摘要
目的应用TMT标记结合生物信息学分析技术,研究柚皮素磷脂复合物(NPC对大鼠实验性脉络膜新生血管形成的蛋白质组学的影响。方法建立大鼠脉络膜新生血管模型,随机分为模型组、NPC组和正常对照组,应用TMT标记技术进行蛋白质组学研究,通过检索数据库Gene Ontology Database,对筛查到的差异蛋白进行生物信息学分析。结果获得特有肽段序列10819个,蛋白质2717个。模型组和NPC组、模型组和正常对照组、NPC组和正常对照组,差异表达蛋白分别为113个(上调57个,下调56个)、314个(上调202个,下调112个)、90个(上调22个,下调68个)。通过分析得到这些差异蛋白具有结合作用、抗氧化活性、催化活性、转运活性、转录调节等重要的分子生物学功能。结论基于TMT技术的蛋白质组学方法有助于鉴定出脉络膜新生血管相关的差异蛋白质,为进一步研究柚皮素磷脂复合物抑制实验性脉络膜新生血管的机制提供依据。
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单位南京医科大学; 江苏省中医院