‘枸头’橙针刺和枝的转录组分析

作者：孙立方; 柯甫志; 聂振朋; 王平; 孙建华; 黄秀; 徐建国^*

来源：分子植物育种, 2020, 18(19): 6290-6297.

DOI：10.13271/j.mpb.018.006290

• ‘枸头’橙
• 针刺
• 枝
• 转录组分析
• 差异表达基因

柑橘枝干多具针刺,造成树冠管理困难,增加果实机械伤害,给果实采收也带来不便,对生产不利。但是,目前柑橘针刺发育和调控的分子机制尚不清楚,也无相关报道。本研究以‘枸头’橙(Citrus aurantium L. cv.’Goutou’Cheng)为研究材料,利用高通量测序平台Illumina HiSeq X Ten对针刺和枝进行了转录组测序。测序数据初步分析后共筛选到5 441个差异表达基因,其中包含上调表达基因2 881个、下调表达基因2 560个。GO富集结果表明差异表达基因主要集中在生物过程(3 170个基因)、代谢过程(2 396个基因)、单生物过程(1 742个基因)、氧化还原酶活性(520个基因)和结合活性(359个基因)等。差异表达基因KEGG代谢通路富集分析表明,富集程度比较显著的通路包括:次生代谢物生物合成(271个基因)、植物激素信号转导(73个基因)和苯丙素生物合成(55个基因)路径。其中,KEGG代谢通路富集分析结果表明次生代谢物合成的差异可能是针刺和枝的发育不同的重要因素,也暗示着次生代谢物合成路径可能在针刺发育过程起关键调控作用。本研究对枸头橙针刺和枝进行转录组测序并比较分析,为后期筛选柑橘针刺发育调控的关键基因和深入研究其分子调控机制提供了科学基础。

• 单位
  浙江省柑橘研究所