高粱低氮相关miRNA的表达聚类及染色体定位分析

作者：马建华^*; 赵红梅; 杨艳君; 冯玉杰; 史胜利

来源：分子植物育种, 2023, 1-12.

• 高粱
• 低氮
• miRNA
• 聚类
• 染色体定位

为深入了解miRNA在高粱低氮胁迫反应中的调控作用，本试验对高粱幼苗进行短时(8 h)和长时(15 d)低氮胁迫处理，利用Solexa深度测序技术结合生物信息学分析方法，筛选低氮相关差异表达的miRNA，并对其表达量进行聚类分析。同时利用TBtools软件对差异表达的miRNAs进行染色体定位分析。结果显示：低氮胁迫下，高粱根系和叶片中均有大量特有的小分子RNA序列，说明低氮胁迫可诱导高粱中小分子RNA的表达改变。对差异表达的miRNA进行聚类分析，根系中miRNA的表达聚为5种类型，叶片中miRNA的表达聚为4种类型。107个差异表达miRNAs不均匀分布在不同的染色体上，其中4号染色体上分布的最多。本试验结果为探究高粱耐低氮机制及培育耐低氮高粱品种奠定基础。

• 单位
  晋中学院