辣椒4CL基因家族成员的鉴定与生物信息学分析

作者：何磊; 严希; 袁圆; 余伟; 李伟; 赖卫; 刘崇政; 杨红^*

来源：分子植物育种, 2022, 20(08): 2478-2484.

DOI：10.13271/j.mpb.020.002478

• 辣椒(Capsicum annuum)
• 4CL基因家族
• 生物信息学分析
• 木质素

4-香豆酸：辅酶A连接酶(4-coumarate:CoA ligase, 4CL)基因家族调控植物木质素代谢、参与类黄酮和其他次生代谢产物合成。为了解辣椒Ca4CL基因家族的分子特性及生物学功能。本研究基于辣椒的全基因组测序结果鉴定4CL基因家族，并进行生物信息学分析。结果共鉴定获得8条辣椒4CL基因，不均匀的分布于基于3、7、11和12号染色体，其中Ca4CL06和Ca4CL08未锚定；辣椒Ca4CL的外显子数目在5～6之间，基序分析结果保守；分析顺式作用元件发现，在辣椒Ca4CLs上游2 000 bp序列中存在多个响应元件，包括光、Me-JA、厌氧诱导、低温等响应元件。辣椒4CL基因家族表达分析发现Ca4CL01在根、茎、叶、果皮(开花期后25 d,绿果期,转色期,转色10 d)、胎座(转色期,转色5 d,转色10 d)中均无表达，其余Ca4CLs表达具有较强组织特异性，Ca4CL04在叶、根、果皮等时期高表达。本研究为进一步分析Ca4CLs基因在生长发育、胁迫等条件下的功能和相应的信号转导途径提供了理论依据。

• 单位
  贵州省生物研究所; 贵州大学