火龙果HuICE1基因的克隆与表达分析

作者：陈翠; 王卓; 谢碧玉; 任陪娣; 徐碧玉; 金志强; 黄绵佳; 从心黎^*

来源：分子植物育种, 2019, 17(23): 7706-7713.

DOI：10.13271/j.mpb.017.007706

• 火龙果(Hylocereus undatus)
• HuICE1
• 基因克隆
• 表达分析

本研究以‘金都一号’红心火龙果(Hylocereus undatus)为实验材料,利用ICE序列3’端的高度保守结构域(bHLH),采用同源克隆法从火龙果果肉中分离得到一条HuICE1序列,其cDNA序列全长1 673 bp,具有一个1 596 bp的完整开放阅读框,生物信息学分析显示该基因编码的蛋白定位于细胞核,为水溶性蛋白。蛋白结构预测发现,HuICE1蛋白属MYC2型转录因子,在3’端第340～384个氨基酸含有高度保守的bHLH结构域,表明HuICE1基因属bHLH家族,还有核定位信号(NLS)区、富S区、转膜区、类泛素化(SUMO)结合位点各1个。同源性分析表明,火龙果与甜菜(Beta vulgaris)的核苷酸序列相似度最高,为85.10%。qRT-PCR表达分析表明,在火龙果各个组织中HuICE1均有表达,说明该基因是组成型表达,此研究为后续研究火龙果抗逆机制提供理论依据。

• 单位
  农业部; 中国热带农业科学院热带生物技术研究所; 海南大学