基于全长转录组的盐生草WRKY基因家族的鉴定及其盐胁迫响应模式分析

作者：陈倩; 徐晓芸; 汪军成; 姚立蓉; 司二静; 杨轲; 韦晓玲; 马小乐; 李葆春; 尚勋武; 孟亚雄^*; 王化俊^*

来源：草业学报, 2022, 31(12): 146-157.

• 盐生草
• WRKY基因家族
• 盐胁迫
• 生物信息学

WRKY是一类植物特有的转录因子，尤其在植物生长、发育和逆境过程中起到至关重要的作用。为了鉴定盐生草WRKY基因家族成员、揭示其进化关系及探究HgWRKYs基因在盐胁迫下的表达响应模式，本研究基于盐生草全长转录组数据，利用生物信息学方法对其WRKY转录因子进行鉴定与分析，并通过qRT-PCR方法检测了HgWRKYs家族成员在盐胁迫下的相对表达量。结果表明，在盐生草转录组中共鉴定出31个HgWRKYs，氨基酸数介于220～611 aa，其蛋白N端均具有完整的WRKYGQK保守序列；除HgWRKY20和HgWRKY21同时分布于细胞核和线粒体外，其余HgWRKY基因均位于细胞核；系统进化分析将其分为Ⅰ（8个）、Ⅱ（22个）、Ⅲ（1个）三类，第Ⅱ类进一步分为Ⅱ-a(1个)、Ⅱ-b(2个)、Ⅱ-c(1个)、Ⅱ-d(15个)和Ⅱ-e(3个)5个亚类；Motif 1和Motif 2是HgWRKYs基因家族的特征基序，在进化过程中较为保守。qRT-PCR结果表明，HgWRKYs主要在根系中表达，具有组织特异性，其中HgWRKY19、HgWRKY23和HgWRKY27基因在24 h的表达量最高，将其作为盐胁迫响应候选基因，以期为后续研究盐生草WRKY基因响应盐胁迫的分子机制提供依据。

• 单位
  甘肃农业大学; 生命科学技术学院