胶质母细胞瘤长链非编码RNA表达谱分析

作者：朱镇宇; 黄翔; 孙俊龙; 施金龙

来源：交通医学, 2021, 35(03): 227-231.

DOI：10.19767/j.cnki.32-1412.2021.03.004

• 长链非编码RNA
• 胶质母细胞瘤
• 分子标志物
• 靶点

目的:分析胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)中长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)表达谱,阐明GBM中lncRNAs的表达特点,为探寻新的GBM分子标志物及治疗靶点提供研究方向。方法:对6例正常脑组织及6例GBM肿瘤组织的lncRNAs进行高通量转录组测序,从中筛选出GBM中差异表达最显著的lncRNAs,对差异表达的lncRNAs进行GO富集化和通路富集化分析。结果:高通量转录组测序发现,与正常脑组织相比,在GBM中有399个lncRNAs表达上调,569个lncRNAs表达下调。进一步筛选出20个差异表达最显著的lncRNAs,GO富集化分析显示这些lncRNAs在与GBM密切相关的单细胞行为、细胞组分中的突触部分等显著富集。通路富集化分析表明,差异表达的lncRNAs在"谷氨酸能突触"、"Ras信号通路"、"酒精成瘾"、"ErbB信号通路"等显著富集。结论:GBM中存在众多差异表达的lncRNAs,这些差异表达的lncRNAs在与GBM密切相关的重要生物学过程,细胞组分,分子功能,以及多种信号通路中显著富集,为探索新的GBM诊疗方法提供可靠的研究方向。

• 单位
  南通大学; 南通大学附属医院