猪DAZL启动子克隆、转录表达及蛋白功能特性分析

作者:许静; 张霞; 刘志朋; 王淑燕; 李洪林; 李小伟; 王配; 霍金龙
来源:四川农业大学学报, 2023, 41(06): 1098-1106.
DOI:10.16036/j.issn.1000-2650.202307269

摘要

【目的】研究猪类无精症缺失基因DAZL在版纳微型猪近交系(Banna mini-pig inbred line, BMI)中的启动子特征、转录表达及蛋白功能。【方法】使用PCR技术克隆DAZL启动子序列,并分析其结构;使用RNA测序技术获得BMI睾丸组织中DAZL的表达量,并构建转录调控网络;分析DAZL的氨基酸同源性与蛋白功能特性,并构建互作蛋白网络。【结果】成功扩增了DAZL长度为2 378 bp的启动子序列,含1个CpG岛、3个核心启动子以及Oct-1、Sp1、Pit-1a等10种转录因子结合位点;DAZL在BMI睾丸组织中有较高的正表达;ceRNA调控网络分析表明DAZL被sscmiR-199a-5p、ssc-miR-199b-5p、ssc-miR-17-5p、ssc-miR-103、ssc-miR-24-3p和ssc-miR-107等6个miRNAs靶向调控;功能注释发现其主要在精子发生、生殖细胞发育、翻译调控中发挥重要功能。DAZL及其邻近基因分析发现其在各物种中高度保守,且具有较为保守的邻近基因;蛋白互作网络、GO和KEGG富集分析显示DAZL与PUM2、DAZAP2和SYCE1等多个蛋白互作,主要参与精子发生、卵子发生、有性生殖等重要生殖相关通路;转录组数据与蛋白编码基因之间的表达量相关性显示DAZL的表达量与SOHLH1显著相关。【结论】本研究从DNA、RNA和蛋白质角度全面分析了猪DAZL的启动子结构、转录表达和蛋白功能,结果为更进一步研究DAZL在精子发生中的作用奠定了基础。

全文