基于高效SNP芯片的小麦产量相关性状全基因组关联分析

作者：刘丽华; 刘阳娜; 周悦; 李宏博; 张明明; 屈平平; 赵昌平^*; 庞斌双^*

来源：麦类作物学报, 2023, 43(11): 1404-1416.

• 小麦
• 产量相关性状
• 关联分析
• SNP芯片

挖掘小麦产量相关性状的稳定关联位点，为相关基因克隆和分子标记辅助选择提供理论依据。本研究以248个中国北部冬麦区育成品种为材料，利用自主研发的Affymetrix BAAFS Wheat 90K SNP芯片对株高、穗长、小穗数、穗粒数、有效分蘖数、粒长、粒宽和千粒重共8个产量相关性状进行全基因组关联分析。共检测到158个与8个性状显著关联(P≤0.00001)的SNP位点，其中45个位点至少在两个环境中稳定表达，解释平均表型变异的3.60%～10.51%。在这45个位点中，有8个稳定关联位点与以往的研究结果一致；37个为新发现稳定位点，其中3个与株高稳定关联的位点，分布在7D染色体上，解释表型变异的3.60%～4.39%;9个与穗长稳定关联的位点，分别分布在1D、3A、5B和7D染色体上，解释表型变异的5.61%～8.42%;1个与穗粒数稳定关联的位点，分布在7D染色体上，解释表型变异的6.06%～7.22%;8个与有效分蘖数稳定关联的位点，分布在1B染色体上，解释表型变异的6.33%～8.73%;6个与粒长稳定关联的位点，分别分布在2A和5B染色体上，解释表型变异的5.45%～6.62%;7个与粒宽稳定关联的位点，分别分布在4B和5A染色体上，解释表型变异的6.90%～10.51%;3个与千粒重稳定关联的位点，分布在3A染色体上，解释表型变异的7.05%～7.69%;对稳定位点进行候选基因分析，筛选到45个候选基因，其中有功能注释的基因41个，其中4个位于基因内。

• 单位
  北京市农林科学院