结直肠癌中lincRNAs表达特征的初步研究

作者：古志强; 唐健; 黄凤婷; 庄燕妍; 彭娟菲; 姚和瑞; 张世能

来源：肿瘤, 2014, 34(03): 245-252.

• 结直肠肿瘤
• 长链非编码RNA
• 芯片分析技术
• 系统生物学

目的 :探讨结直肠癌中长链基因间非编码RNAs(long intergenic non-coding RNAs,lincRNAs)的表达特征。方法 :采用基因芯片技术检测4例结直肠癌及癌旁正常黏膜组织中长链非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs)与mRNAs的表达情况,筛选出差异表达的lincRNAs与mRNAs并用MeV 4.6软件行聚类分析;进一步采用上海伯豪生物技术有限公司的生物芯片分析系统(SBC Analysis System,SAS)分析其相关信号转导通路;采用实时荧光定量-PCR方法验证linc-UCC、linc-DCC与MIR143HG在癌组织及癌旁组织中的表达情况,并分析与结直肠癌临床特征之间的相关性。结果 :采用基因芯片共检测到42 545个RNA,其中124个lincRNAs和1 583个mRNAs的表达有明显差异。生物信息学分析结果显示,有29条信号转导通路可能与这些lincRNAs有关。linc-UCC在较多结直肠癌组织中表达增多,其高表达与肿瘤淋巴结转移密切相关;而linc-DCC与MIR143HG在多数结直肠癌组织中表达减少,二者呈正相关性。结论 :通过基因芯片技术筛选获得与结直肠癌相关的lincRNAs,以期为结直肠癌的临床诊断及治疗提供一些新的靶点。

• 单位
  中山大学孙逸仙纪念医院; 中山大学附属第六医院