植物病原丝状真菌G蛋白偶联受体的预测方法对比研究

韩长志; 薄淑文

doi:10.13323/j.cnki.j.fafu(nat.sci.).2023.05.005

摘要

植物病原丝状真菌G蛋白偶联受体(GPCR)在实现外界信号感知和传递过程中发挥着重要作用。基于GPCR蛋白所具有的典型7个跨膜保守结构域及非典型保守结构域，通过总结前人已报道的候选GPCR的同源比对方法，对其跨膜结构域数量预测方法及跨膜结构蛋白数据库进行对比，明确TOPCONS是目前预测GPCR跨膜结构域的较好方法。然后，选择NCBI数据库中223个不同真菌的GPCR蛋白序列通过TOPCONS和TMHMM进行对比分析，结果显示，2种软件对GPCR跨膜结构域数量的预测结果不尽相同，TOPCONS预测结果的准确度较高；进一步对上述GPCR蛋白序列的氨基酸数目进行分析，明确具有7个跨膜结构域的GPCR蛋白氨基酸数目为200～1 406个。该研究可为进一步开展植物病原丝状真菌GPCR蛋白的结构预测及其功能研究提供参考。

单位
西南林业大学

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更新时间：2024-07-25 14:54

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