利用转录组学分析滇白前根三萜皂苷合成通路的基因簇

作者：孙浩田; 王晓丽; 曹子林^*

来源：分子植物育种, 2023, 1-16.

• 滇白前
• 根
• 转录组测序
• 三萜皂苷合成

滇白前根具有镇痛、清热的功效，其中主要成分皂苷类物质还具有良好的抗癌作用。为了解根转录组及其三萜皂苷生物合成的基因。通过高通量测序技术，在平台Illumina Novaseq 6000对滇白前根样品进行无参照转录组测序，并通过KEGG对三萜皂苷相关合成基因进行挖掘。结果表明：共获得N50为1 552 bp，平均长度为915.28 bp的46 595个Unigenes。注释到6大功能数据库(NR， COG， Pfam， Swiss-Prot， GO， KEGG)上的Unigene总数为26 337个。NR数据库比对到的Unigenes有25 201条，与甜菜、藜麦、菠菜有较高同源性；GO数据库注释到的Unigene主要集中在结合、催化及细胞部分；COG的注释结果以未知功能的占比最高；KEGG数据库的注释结果以碳水化合物代谢通路的Unigenes最多。共有4条代谢途径参与三萜皂苷生物合成，其中萜类物质骨架合成途径中包括MVA途径13个Unigene、MEP途径17个Unigene，及形成FPP的10个Unigene；倍半萜和三萜生物合成通路，涉及7个Unigene。有MYB、bHLH、WRKY 3个转录因子与滇白前三萜类化合物生物合成相关。本研究为三萜皂苷的合成关键基因克隆、功能验证及调控提供了依据。

• 单位
  西南林业大学