水稻遗传育种相关生物信息数据库和工具的研究进展

作者:彭歆; 钱乾; 谭健韬; 彭波; 甘玉立; 王成睿; 刘琦; 沈梦圆
来源:华南农业大学学报, 2023, 44(06): 854-866.
DOI:10.7671/j.issn.1001-411X.202306065

摘要

水稻Oryza sativa L.是主要的粮食作物,也是单子叶植物研究的模式植物。面对日益严峻的环境和人口压力,培育高产、优质、环境适性强的水稻品种是解决当前粮食安全问题的有效途径。随着多组学技术的快速发展,积累了海量的水稻遗传育种相关的数据。生物信息数据库和在线分析工具是存储这些数据的载体,用以整合、可视化和共享数据,并为数据的深入挖掘和利用提供工具,从而为育种决策提供数据支撑。本综述系统梳理了近20年来开发的水稻生物信息数据库和在线分析工具,并基于内置数据集和功能对它们进行了分类和总结。最后,讨论了现有的水稻生物信息数据库和在线分析工具的问题与不足,并对它们在大数据和人工智能时代的发展方向进行了展望。

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