基于新三维图形表示及相似度量的DNA序列比较分析(英文)

作者：田智鲲; 肖前军; 周立前

来源：湘潭大学自然科学学报, 2010, (03): 17-21.

DOI：10.13715/j.cnki.nsjxu.2010.03.009

• 图形表示
• DNA序列
• 几何中心
• 波动幅度
• 相似度量
• 相似分析 graphical representation
• DNA sequence
• geometrical center
• fluctuation
• similarity measure
• similarity analysis

基于DNA序列的混沌游戏表示,得到了一种新的能够避免信息损失的DNA序列的3维图形表示.同时,利用特征曲线的几何中心和波动幅度构造4维向量来刻画DNA序列.基于两种新的相似度量,对11种物种的β球蛋白基因序列进行相似性分析,所得结果与生物学中的进化关系基本一致.而且通过比较分析,提出的方法对较长生物序列的相似分析更有效.

• 单位
  湖南工程学院; 湘潭大学; 湖南理工职业技术学院