利用GEO数据库分析肝细胞癌组织中着丝粒蛋白F基因的表达及其与预后的相关性

作者：樊斌; 张勇; 李锦貌; 刘涛; 张家耀

来源：临床肝胆病杂志, 2018, 34(07): 1475-1480.

• 癌,肝细胞
• 着丝粒蛋白F
• 基因表达
• 预后

目的探讨着丝粒蛋白F(CENPF)基因在肝细胞癌(HCC)患者组织中的表达情况及与临床特征和预后的相关性。方法利用在线工具Oncomine分析CENPF在HCC与正常肝组织的表达情况,从美国国立生物技术信息中心的GEO数据库下载相关芯片数据(GSE14520),收集215例HCC组织的基因表达谱及相关临床数据,将其分为CENPF低表达组(n=107)和CENPF高表达组(n=108)。对样本中的CENPF基因表达数据及其对应的临床信息进行分析。计量资料组间比较采用t检验;计数资料组间比较采用χ2检验;生存分析采用log-rank(Mantel-Cox)检验;生存资料单因素及多因素分析采用Cox比例风险模型。结果数据集证实HCC组织中CENPF表达水平明显高于正常肝组织(t=12.217,P<0.001)。CENPF基因表达水平与AFP水平、肿瘤大小、TNM分期、转移风险有关系(χ2值分别为6.463、4.338、7.951、17.331,P值均<0.05)。生存分析显示CENPF高表达患者预后明显差于CENPF低表达组(风险比=1.92,95%可信区间:1.242.96,P=0.005)。Cox单因素分析显示,HCC患者预后与AFP水平、肿瘤直径、合并肝硬化、肿瘤分期、转移风险及CENPF表达相关(P值均<0.05);Cox多因素分析显示,合并肝硬化、肿瘤分期及CENPF高表达是HCC患者预后的独立危险因素(P值均<0.05)。结论 CENPF基因高表达可能与HCC进展相关,可作为HCC患者的潜在预后生物标志物。

• 单位
  恩施土家族苗族自治州中心医院