猪8号染色体影响产仔数性状的QTL精细定位

作者:蒋能静; 侯黎明; 刘晨曦; 周天威; 张萍; 黄媛; 陆志强; 华金弟; 周腾彬; 阮丽莎; 石晓峰; 李平华*; 黄瑞华*
来源:中国畜牧杂志, 2021, 57(S1): 76-83.
DOI:10.19556/j.0258-7033.20210617-07

摘要

实验旨在基于前期从二花脸猪群体鉴别到的猪8号染色体上影响产仔数性状的数量性状基因座(Quantitative trait loci,QTL),通过增加群体的数量(二花脸猪和梅山猪)以及分子标记的密度(1个SNP/14.5kb),利用单标记关联分析和合并群体的荟萃分析精细定位猪8号染色体影响产仔数的QTL,并挖掘QTL区域内候选基因。结果表明,基于二花脸猪群体的单标记关联分析,将影响经产胎次(2~7胎)产活仔数(Number born alive,NBA)的QTL分别精细定位至33 818 121~34 324 224 bp;基于梅山猪群体的单标记关联分析,将影响经产胎次(2~7胎)NBA的QTL分别精细定位至33 884 473~34 156 584 bp;基于二花脸猪群体和梅山猪群体荟萃分析,将影响经产胎次(2~7胎)NBA的QTL精细定位到33 934 355~34094188bp;最后将关联分析和荟萃分析重叠,将影响猪经产胎次(2~7胎)NBA的QTL精细定位到33934355~34094188bp;并且在QTL区间内发现UCHL1为关键位置功能候选基因。综上,本研究通过增加群体和标记密度成功在猪8号染色体上精细定位影响产仔数的QTL,并在QTL精细定位区间内发现UCHL1基因为影响猪产仔数的候选基因。

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