基于InDel标记分析305份中国甘薯登记品种遗传多样性

作者:唐芬; 赵路宽; 苏一钧; 肖世卓; 袁蕊; 翁宗宽; 戴习彬; 陈艳丽; 周志林; 曹清河*
来源:植物遗传资源学报, 2023, 1-11.
DOI:10.13430/j.cnki.jpgr.20230928002

摘要

对甘薯育成品种进行亲缘关系评价,是了解其遗传背景并有效利用种质资源的重要前提。利用本课题组开发的23对InDel引物,通过荧光毛细管电泳技术对305份中国甘薯登记品种进行基因型分析,扩增共获得56个位点,其中53个位点具有多态性,多态率达94.6%。品种间遗传距离最小为0.1111,最大为0.6977,平均遗传距离为0.3624。PIC值在0.2212~0.6016区间内,平均值为0.4098。遗传多样性分析表明,NJ (Neighbor-Joining)聚类结果将群体划分为4个主要类群(I、II、III、IV),分别包含有40份、74份、17份和174份种质。以甘薯的传统种植区域进行划分,聚类图中显示北方薯区和长江流域薯区的品种在类群I、II、III和IV中均匀分布,南方薯区主要(77.03%)集中于类群IV中,这一聚类结果与群体结构研究和主坐标分析(PCoA)基本一致。本文将分子标记结果与系谱信息相结合,初步表明中国甘薯登记品种的亲缘关系较近,遗传背景狭窄,为甘薯的种质创新、新品种选育提供参考。

全文