211例中国南方地区结核分枝杆菌48-locus MIRU-VNTR基因分型分析

作者：王楠; 吴玲; 牛群; 雷杰; 孟繁荣; 杨瑜; 谢贝; 高俊文; 刘志辉^*

来源：国际医药卫生导报, 2019, (09): 1374-1378+1374+1378+1383.

• 结核分枝杆菌
• MIRU-VNTR
• HGDI
• 基因分型

目的 探讨适合于中国南方地区结核分枝杆菌基因分型的MIRU-VNTR基因分型技术。方法 复苏培养211例结核分枝杆菌,提取DNA后PCR扩增48个VNTR位点进行48-locus MIRU-VNTR基因分型分析,计算Hunter Gaston Discriminatory Index(HGDI)并以其大于0.6为标准确定适于中国南方地区结核分枝杆菌基因分型分析的位点组合。结果 48个位点中30个位点能够得到稳定扩增,HGDI值介于0.09和0.87之间。其中VNTR3192、VNTR2996、VNTR2461、VNTR4052、VNTR4155、VNTR1895、VNTR1955、VNTR0960、VNTR4348、VNTR0595、VNTR1305、VNTR0154、VNTR2687、VNTR2401、VNTR2347、VNTR1907等16个VNTR位点HGDI值均高于0.6,属于高分辨力位点,16位点组合总HGDI大于0.98。结论 中国南方地区进行结核分枝杆菌MIRU-VNTR基因分型相关研究时,应至少将上述16个位点纳入分型分析之中。

• 单位
  广州市胸科医院