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摘要
目的了解2013—2021年深圳市急性腹泻人群副溶血性弧菌的感染状况及基因组流行病学特征。方法对深圳市感染性腹泻监测系统主动监测的急性腹泻病例进行流行病学数据收集和统计, 对分离到的副溶血性弧菌菌株进行全基因组测序, 划分克隆群并分析血清型, 毒力基因及多位点序列型别, 采用单核苷酸多态性变异位点差异分析2019—2021年腹泻监测人群的暴发簇。结果 2013—2021年深圳市15家哨点医院共监测急性腹泻病例48 623例, 分离到副溶血性弧菌1 135株, 阳性分离率为2.3%。全基因组测序共获得852株菌的基因组数据, 序列分析获得29种血清型、21种已知ST型和5种新ST型, tdh+trh-菌株占比达93.2%;种群结构包含8个全基因组克隆群(CG), 以CG3占绝对优势, 其次为CG189。CG3以O3:K6血清型和ST3序列型为主;CG189以O4:KUT、O4:K8血清型和ST189a、ST189序列型为主。2019—2021年共发现13个基因簇, 包含154个病例, 以及发现30个暴发簇, 其中29个暴发簇均由CG3菌株引起。结论副溶血性弧菌是深圳市急性感染性腹泻的主要病原菌, CG3和CG189长期流行并占主导地位, 存在被忽略的散在暴发及持续的共同污染来源;针对流行克隆群进行溯源和采取精准防控措施, 有望大幅减轻副溶血性弧菌感染引起的腹泻疾病负担。
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