盐干海参的2种核酸提取方法比对及其分子鉴定

作者：谢艳辉; 李家侨; 胡思敏; 李红权; 斯泽恩; 郑舒尹; 张娜^*; 刘荭

来源：食品安全质量检测学报, 2022, 13(11): 3652-3659.

DOI：10.19812/j.cnki.jfsq11-5956/ts.2022.11.041

• 盐干海参
• 核酸提取
• 分子鉴定

目的 建立盐干海参的核酸提取及其分子鉴定方法。方法 选取5种盐干海参,采用直接处理、洗涤处理和浸泡处理3种处理方式,比较磁珠法和离心柱法两种核酸抽提方式的提取质量,并采用聚合酶链式反应(polymerasechainreaction,PCR)法对提取的核酸进行分析确认。结果 同一种抽提方式不同海参处理组间核酸质量没有显著差异,而两种抽提方式间核酸质量差异显著,其中磁珠法提取的核酸得率高、纯度高,而离心柱法提取的核酸得率及纯度均偏低。经PCR扩增验证,磁珠法提取的核酸效果较佳。将扩增产物进行测序及系统进化分析发现5种海参实际种类与标注名称仿刺参存在较大差异。结论 盐干海参处理方式对核酸提取结果影响不大,磁珠法提取核酸效果较好,单纯依靠细胞色素c氧化酶亚基I(cytochromecoxidase subunit I, COI)和16S rRNA基因通用引物并不能对所有的海参种类进行鉴定。

• 单位
  中国科学院南海海洋研究所