密码子的使用对蛋白表达具有重要的影响。密码子的自然选择影响翻译的准确性和效率,而调控基因转录、可变性剪接和RNA结构等可以影响基因表达模式。本文结合模式生物脉孢菌、蓝藻以及果蝇生物钟基因的密码子选择特点,阐述了非最优密码子使用偏好性对生物钟基因表达模式及功能的影响。