中国野莲居群遗传多样性及群体结构分析

作者：刘正位; 肖彬; 朱红莲; 匡晶; 季群; 彭静; 李峰; 孙亚林; 柯卫东^*

来源：植物科学学报, 2021, 39(03): 278-287.

• 莲
• 野莲居群
• 遗传多样性
• SLAF简化基因组测序

以我国长江中下游地区和北方地区33个居群的195份野莲(Nelumbo nucifera Gaertn.)为材料,基于SLAF简化基因组测序技术,对不同区域野莲居群的遗传多样性进行研究。结果显示:通过测序共得到742 992个SLAF标签,挖掘高质量SNP位点1 064 789个;供试材料基因型差异明显,主要可分为长江流域和东北区域2个亚群。研究结果支持长江流域野莲和东北区域野莲应分属为亚热带及温带生态型莲。我国野莲居群总多样性较低(π=1.04×10-5),居群间平均分化系数较高(FST=0.42)。长江中下游地区不同湖泊野莲π值变幅为0.5×10-5～2.2×10-5,梁子湖野莲多样性最为丰富。梁子湖区域内各个小湖π值为3.13×10-6～2.3×10-5,表明小湖内不同居群仍存有较大遗传差异。北部地区不同湖泊野莲π值变幅为3.05×10-6～1.50×10-5,山东梁山古代莲多样性最为丰富。长江中下游地区野莲遗传多样性高于北部地区且两者间分化程度较高(FST=0.34),表明野莲居群间和区域间均有较高的分化程度,原因可能是野莲居群内主要为克隆繁殖,而居群间基因交流少所致。

• 单位
  园艺林学学院; 华中农业大学; 武汉市农业科学院