青海云杉响应锈菌侵染转录组分析

作者：李海兰; 白露超^*

来源：干旱区资源与环境, 2023, 37(11): 140-149.

DOI：10.13448/j.cnki.jalre.2023.266

• 青海云杉
• 锈菌
• 转录组
• 互作

为探究锈菌与青海云杉之间的互作机制，利用Illumina测序平台对青海云杉健康植株和发病植株进行转录组测序，以差异倍数(FC)≥2且错误发现率(FDR)<0.01为标准，共获得15408个差异表达基因，有10296个差异基因上调，5112个差异基因下调。GO注释中，DEGs显著富集到代谢过程、细胞过程、催化活性和结合等过程。KEGG注释中，DEGs显著富集到核糖体、植物与病原互作、内质网蛋白加工、信号转导等过程，通过分析相关通路发现，青海云杉响应锈菌侵染的分子机制受多基因网络系统的调控。为验证RNA-seq数据的可靠性，对10个DEGs进行RT-qPCR表达量检测，验证结果为，RT-qPCR和RNA-seq测得的基因表达趋势基本一致。这有助于深入研究候选基因在青海云杉响应锈菌侵染中的作用，同时也为开展青海云杉抗病功能基因组学研究奠定基础。

• 单位
  青海大学农牧学院