基于RNA-seq技术分析德州驴不同部位肌肉的差异表达基因

作者：许静; 姚欢丰; 程杰; 王延涛; 李泽宇; 曲洪磊; 李孟孟; 朱明霞; 王长法; 柴文琼^*

来源：扬州大学学报（农业与生命科学版）, 2023, 44(05): 71-78.

DOI：10.16872/j.cnki.1671-4652.2023.05.009

• 驴
• RNA-seq
• 差异表达基因
• 肉质性状
• 骨骼肌

以德州驴为研究对象，利用转录组学(RNA-seq)技术对其背最长肌、腿后腱、臀大肌不同部位差异表达基因进行测序，筛选调控驴肉品质性状的关键基因，探究不同部位驴肉差异的分子机制。结果表明：筛选获得了臀大肌与背最长肌差异表达基因124个，其中上调基因73个，下调基因51个；腿后腱与背最长肌差异表达基因126个，其中上调基因68个，下调基因58个。对德州驴腿后腱与背最长肌差异基因KEGG通路富集分析发现，差异表达基因主要在赖氨酸降解、β-丙氨酸代谢、脂肪酸降解等通路中高度富集，臀大肌与背最长肌差异表达基因富集氧化磷酸化、亮氨酸和异亮氨酸降解等通路中。同时，肉品质相关候选基因GCDH、ALDH2、IGF1、VGLL2、TECRL、ASS1、ATP5A1、MUT、ACADSB参与肌肉氨基酸脂肪酸代谢过程，在肌肉生长过程中发挥着重要作用。

• 单位
  聊城大学; 东阿阿胶股份有限公司; 动物科技学院; 中国农业大学