我国苏南地区美洲鲥7个养殖群体的遗传多样性分析

作者：李玉林; 罗明坤; 冯冰冰; 朱文彬; 傅建军; 梁政远; 解旭东; 缪凌鸿; 董在杰^*

来源：上海海洋大学学报, 2023, 1-15.

• 美洲鲥
• 微卫星
• D-loop区
• 遗传多样性

为探讨苏南地区美洲鲥(Alosa sapidissima)养殖群体的种质资源现状及遗传多样性水平，本研究采用15个微卫星标记和线粒体D-loop序列，对7个不同群体：镇江丹徒(Dtq)、镇江扬中(Yzq)、苏州张家港(Zjg)、苏州相城(Xcq)、南通中洋(Zyq)、常州滆湖(Ghq)和常州武进(Czq)共计210尾个体，进行了群体多样性分析。结果显示，15个SSR位点中除Asa-12外，其余位点均表现为高度多态性(PIC > 0.5)。其中，7个群体期望杂合度He为0.615～0.758，多态信息含量PIC为0.568～0.723，两者均以Zjg群体最高。D-loop序列共检测到32个变异位点，定义了20个单倍型，其中Zjg群体单倍型最多(11个)。7个群体的单倍型多样性、核苷酸多样性指数分别为0.618～0.945、0.003～0.008。基于SSR和D-loop序列的遗传距离分析，发现Ghq群体和Zyq群体的Nei’s遗传距离(0.058)和K2P遗传距离(0.003)最近，低于其他群体间的遗传距离(分别为0.073～0.397和0.003～0.006)。综合分析，我们发现7个美洲鲥群体的遗传多样性较为丰富，而群体间遗传变异程度不高，基因流Nm > 1和镶嵌式排列的个体进化树也证实7个群体的亲缘关系较近。基于本研究，可初步了解苏南地区鲥的种质现状，为后续进一步开展育种工作奠定理论基础。

• 单位
  中国水产科学研究院淡水渔业研究中心; 南京农业大学