基于高通量测序分析花生不同器官内生细菌群落多样性

作者：李亮亮; 雷高; 李磊; 杜志敏; 甄静; 王继雯; 刘德海; 杨文玲^*

来源：花生学报, 2021, 50(02): 1-7+20.

DOI：10.14001/j.issn.1002-4093.2021.02.001

• 花生
• 高通量测序
• 种群多样性
• 内生细菌
• 物种丰度

通过Illumina MiSeq高通量测序技术,对花生根、茎、叶、花不同器官内生细菌16S rRNA的V5～V7可变区进行测序,研究花生内生细菌群落多样性。从花生不同器官内一共获得61 396条有效序列和468个OTU(Operational Taxonomic Units)。物种分类显示花生内生细菌种类隶属于21个门、43个纲、107个目、177个科和284个属。根部内生细菌优势属为假单胞菌属(Pseudomonas)、慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)和魏斯氏菌属(Weissella),相对丰度分别为37.67%、25.13%和7.38%;茎部内生细菌优势属为假单胞菌属(Pseudomonas)和红球菌属(Rhodococcus),相对丰度分别为73.12%和8.88%;叶部内生细菌优势属为假单胞菌属(Pseudomonas)和红球菌属(Rhodococcus),相对丰度分别为78.65%和8.55%;花部内生细菌优势属为假单胞菌属(Pseudomonas),相对丰度为15.15%。PICRUSt功能预测表明,叶部内生细菌中参与调控各种代谢通路的物种丰度最高,茎部和根部次之,花部最低。以上研究结果表明花生内生细菌具有丰富的种群多样性,为今后开发利用花生内生细菌资源奠定了基础。

• 单位
  河南省科学院生物研究所有限责任公司