鼻咽癌中高表达蛋白激酶及其抑制剂的生物信息学筛选

作者：张姝; 崔晓波; 孙娟

来源：局解手术学杂志, 2016, 25(10): 720-723.

• 鼻咽癌
• 蛋白激酶
• 激酶抑制剂

目的筛选鼻咽癌中高表达的激酶基因以及调控这些激酶的激酶抑制剂,为鼻咽癌的分子治疗提供新的切入点。方法利用GEO数据库和SAM软件筛选鼻咽癌中高表达的激酶基因;利用DAVID数据库获得激酶调控的生物学功能;利用Selleckchem数据库筛选调控这些高表达激酶的激酶抑制剂,再通过文献挖掘技术筛选潜在的抗鼻咽癌新药。结果在鼻咽癌基因组中,我们共筛选出差异表达基因2 360个,其中高表达激酶基因21个,分别为CHEK1、CHEK2、PRKDC、AURKA、VRK2、STK17A、MELK、NUAK1、TRPM7、MASTL、AXL、BUB1、BUB1B、CDK4、TTK、CDC7、CASK、AKT3、TBK1和PBK(Fold Change≥2且P<0.05)。功能分析的结果显示21个高表达激酶主要参与10个功能term中,包括调节细胞活动相关功能,如"protein amino acid phosphorylation""phosphorylation""phosphate metabolic process"和调控细胞周期相关功能,如"mitotic cell cycle""cell cycle phase""regulation of cell cycle"等。通过Selleckchem数据库,我们发现9个高表达激酶具有已被证实的激酶抑制剂51个。文献挖掘的结果显示在这51个激酶抑制剂中,有18个在癌症方面的研究较少,文献小于10篇,具有成为抗鼻咽癌潜力的新药物。结论鼻咽癌中共有21个激酶高表达,并可能通过调控肿瘤细胞周期等生物学功能来发挥促鼻咽癌作用;它们的抑制剂可能有潜在的抗癌作用,为鼻咽癌的分子治疗提供新的靶点。

• 单位
  内蒙古医科大学附属医院