基于网络药理学、分子对接和化学信息学方法探索益肺健脾方治疗肺纤维化的物质基础

作者：靳晓杰; 王燕如; 王玉; 关瑞宁; 罗宏; 石生青; 李潮新; 李丹桂; 张志明; 刘永琦^*

来源：中国现代应用药学, 2020, 37(08): 897-906.

DOI：10.13748/j.cnki.issn1007-7693.2020.08.001

• 网络药理学
• 益肺健脾方
• 肺纤维化
• 整合素αvβ6
• 分子对接
• 层次聚类分析
• 新型冠状病毒肺炎

目的运用网络药理学、分子对接以及化学信息学方法探索益肺健脾方治疗肺纤维化的分子机制和物质基础。方法TCMSP、TCMID数据库下载益肺健脾方11味中药化合物。利用SwissTargetPrediction预测化合物潜在靶点,运用Cytoscape构建化合物-靶点网络。TTD、Drugbank筛选肺纤维化相关靶点,STRING分析靶点蛋白互相作用并进行GO分析和KEGG分析。进一步采用分子对接对化合物与肺纤维化关键靶点整合素αvβ6的亲和能力进行评估,对筛选得到活性较高的化合物进行化学信息学层次聚类分析。结果益肺健脾方与肺纤维化共有靶点27个,PPI分析得到关键靶点6个,GO分析和KEGG分析得到GO条目336个、KEGG通路35条。分子对接获得了具有靶向αvβ6潜在亲和力的成分,eRo5规则和打分排名筛选30个化合进行化学信息学聚类分析,结果显示化合物NaphtholaS-blphosphate、TangshenosideIVqt、(2R)-2-azaniumyl-3-(1H-indol-3-yl)propanoate、(3S)-3-azaniumyl-4-hydroxy-4-oxobutanoate、[(2R)-2-Formyloxy-3-phosphonooxypropyl] formate所代表的骨架结构具有潜在抑制肺纤维化活性,主要相互作用为氢键和疏水相互作用。结论本研究为中医药抗新冠病毒引起肺纤维化的治疗和相关医方的研究提供基于生物信息学、网络药理学、分子对接、化学信息学的系统研究方法。

• 单位
  甘肃中医药大学; 甘肃中医药大学附属医院