烟草Trihelix转录因子家族鉴定及表达分析

作者：李栋成; 李魁印; 韦兴启; 段丽丽; 莫泽君; 刘仁祥^*

来源：亚热带植物科学, 2022, 51(01): 1-12.

• 烟草
• Trihelix转录因子家族
• 抗冷性
• 非生物胁迫

运用生物信息学分析方法，通过对烟草(Nicotiana tabacum)全基因组数据中的Trihelix家族基因的理化性质、染色体分布、染色体共线性、基序组成、基因结构、顺式作用元件及其低温处理下的表达进行完整的鉴定分析，初步解析烟草Trihelix家族成员的结构与功能。从普通烟草中鉴定出32个Trihelix基因，分为GT-1、GT-2、GTγ、SH4、SIP1等5个亚家族；32个Nt TH基因有着10种分布不均匀的基序，且有不同的基因结构，但在同一个亚家族内有相似性；烟草与番茄(Lycopersicon esculentum)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)存在同源的Trihelix基因，普通烟草Trihelix家族自身也存在共线性基因；鉴定出13种不同类型的顺式元件，主要与非生物胁迫、激素和生长发育有关，其中ABRE和MeJA是最多的两个顺式元件，表明Nt TH基因的功能主要与非生物胁迫和生长发育响应调控有关；烟草Nt TH3和NtTH16等11个基因在对低温胁迫的响应方面有着重要作用。本研究挖掘到与烟草抗冷有关的基因，为烟草抗冷性遗传改良提供了理论依据。

• 单位
  安顺学院; 贵州大学; 黔南州烟草公司长顺县分公司